A COFRUTA foi criada na década de 1970 como associação, depois estruturada como cooperativa, com o objetivo de unir os agricultores da região para se fortalecerem nas negociações de seus produtos. Tem como missão incentivar a produção familiar rural, a conservação da floresta e o desenvolvimento sustentável na região. Foca em sistemas de agroecologia e agroindústria e em operações de compra e venda em linha com as necessidades de seus associados.
A COFRUTA busca comercializar de forma justa seus produtos, promovendo renda digna para cooperados e famílias agregadas. Também impulsiona a implantação de sistemas agroflorestais para diversificação da produção e desenvolvimento sustentável.